Das Master-Studium der Wirtschaftsinformatik umfasst drei Semester, in denen regelmäßige Lehrveranstaltungen stattfinden und ein Semester, in dem die Master-Arbeit (Master-Thesis) zu schreiben ist. Damit umfasst das Master-Studium in der Regel 2 Jahre.

Kern des Master-Studiums sind zwei Profillinien, in denen die Studierenden sich intensiv mit dem jeweiligen Fachgebiet auseinander setzen.

Es ist dabei zu unterscheiden zwischen einem eher management- bzw. beratungsorientierten Profil IT-Management und IT-Consulting und eine eher technikorientierten Profil IT-Architektur und IT-Systementwicklung.

Zielgruppe sind Absolventen, die zum einen aus wirtschaftswissenschaftlichen Bachelor- oder Diplomstudiengängen (BWL, Wirtschaftsinformatik)  und zum anderen aus  ingenieurwissenschaftlichen Studiengängen kommen.

Das Master-Studium an der Hochschule Wismar zeichnet sich durch einen hohen Anteil an Projektarbeit aus.  In überschaubaren Gruppengrößen besteht ein enger Kontakt zu Kommilitonen und Professoren.

Der Studiengang zeichnet sich durch gute Ranking-Ergebnisse aus und ist von der ASIIN akkreditiert. ASIIN ist die Akkreditierungsagentur für Studiengänge der Ingenieurwissenschaften, der Informatik, der Naturwissenschaften und der Mathematik

Als Abschluss wird der Grad: Master of Science M.Sc. verliehen.

Nach der Entscheidung der Hochschulrektorenkonferenz sind die Master-Abschlüsse von FH und Universitäten gleichrangig.